Etiketter

Summa sidvisningar

Sidor

Leta i den här bloggen

måndag 2 april 2018

TRIM23 pohdittavaksi:TRIM, jossa on fuusioituneena ARF1-funktio (ARFD1)

https://www.wikigenes.org/e/gene/e/375.html

Tämä EC2.3.2.27  osallistuu inositoliperheen proteiinien metaboliakarttaan.

https://www.wikigenes.org/e/gene/e/375.html

https://www.wikigenes.org/e/ref/e/9003363.html

https://www.wikigenes.org/e/ref/e/10377261.html

Vertailu eri TRIM proteiinien rakenteesta:

Huomaa että TRIM23 omaa ARF. Huomasin tämän kun etsin hakusanalla  sellaisia trimejä joissa on ARF-domeeni  ja niitä olikin vain tämä yksi. Sensijaan ARF perhettä on paljon ja tämä TRIM23 on ARFD1.Tässä tapauksessa  kannattaa katsoa  ARF-perheen funktionaalista karttaa, koska se alkaa olla aika keskeinen solumetaboliassa.

http://embomolmed.embopress.org/content/3/9/513.figures-only
 Figure 1.
Schematic representation of human TRIM family proteins. The TRIM family proteins are classified into 11 subgroups (C‐I to C‐XI) as defined by Short & Cox, 2006, Ozato et al, 2008 and Carthagena et al, 20
. COS, C‐terminal subgroup one signature;
FN3, fibronectin type 3;
 PHD, plant homeodomain;
FIL, filamin‐type Ig;
NHL, NCL‐1, HT2A and LIN‐41;
MATH, meprin and TRAF homology;
ARF, ADP ribosylation factor‐like;
TM, transmembrane;
 UN, unclassified.