https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0006295212005163?via%3Dihub#fig0005
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0006295212005163?via%3Dihub#fig0005
Phosphoinositides (PI) are phospholipids that mediate signaling cascades in the cell by binding to effector proteins. Reversible phosphorylation of the inositol ring at positions 3, 4 and 5 results in the synthesis of seven different phosphoinositides. Each phosphoinositide has a unique subcellular distribution with a predominant localization in subsets of membranes. These lipids play a major role in recruiting and regulating the function of proteins at membrane interfaces [1]. Several bacteria and viruses modulate and exploit the host PI metabolism to ensure efficient replication and survival. Here, we focus on the roles of cellular phosphatidylinositol 4-phosphate (PI4P) and phosphatidylinositol 4-kinases (PI4Ks) during the replication cycle of various viruses. It has been well documented that phosphatidylinositol 4-kinase IIIβ (PI4KIIIβ, EC 2.7.1.67) is indispensable for viral RNA replication of several picornaviruses. Two recruitment strategies were reported: (i) binding and modulation of GBF1/Arf1 to enhance recruitment of PI4KIIIβ and (ii) interaction with ACBD3 for recruitment of PI4KIIIβ. PI4KIII has also been demonstrated to be crucial for hepatitis C virus (HCV) replication. PI4KIII appears to be directly recruited and activated by HCV NS5A protein to the replication complexes. In contrast to picornaviruses, it is still debated whether the α or the β isoform is the most important. PI4KIII can be explored as a target for inhibition of viral replication. The challenge will be to develop highly selective inhibitors for PI4KIIIα and/or β and to avoid off-target toxicity.
...
Various viruses have an impact on the host's lipid metabolism, lipid/membrane transport and lipid mediated signal transduction. A key class of lipids involved in these cellular processes is the class of phosphoinositides (PIs). Phosphatidylinositol (PtdIns) is the basic scaffold of the PIs (Fig. 1).
DOI:
10.1074/jbc.M111.312561 Tietoa vuodelta 2012
Tämä tutkimus on Sars-Cov-1 viruksesta. Tämä sars-Cov-2 on tehnyt olennaisen muutoksen juuri tuohon kohtaan , johon mahdollisesti on voitu kehittää jokin inhibiittori. Koetan ottaa selvää löytyykö nykyisestä pandemisesta jotakin vastaava akilleenkantapääkohtaa. Tässä ei tarkemmin näytetä tai kerrota mekanismia sars-1 viruksessa. (Aichi virus mainitaan).
Phosphatidylinositol kinases (PI kinases) play an important role in the life cycle of several viruses after infection. Using gene knockdown technology, we demonstrate that phosphatidylinositol 4-kinase IIIβ (PI4KB) is required for cellular entry by pseudoviruses bearing the severe acute respiratory syndrome-coronavirus (SARS-CoV) spike protein and that the cell entry mediated by SARS-CoV spike protein is strongly inhibited by knockdown of PI4KB. Consistent with this observation, pharmacological inhibitors of PI4KB blocked entry of SARS pseudovirions. Further research suggested that PI4P plays an essential role in SARS-CoV spike-mediated entry, which is regulated by the PI4P lipid microenvironment. We further demonstrate that PI4KB does not affect virus entry at the SARS-CoV S-ACE2 binding interface or at the stage of virus internalization but rather at or before virus fusion. Taken together, these results indicate a new function for PI4KB and suggest a new drug target for preventing SARS-CoV infection.
Katson Gene Cards tiedon:
Enables 1-phosphatidylinositol 4-kinase activity and 14-3-3 protein binding activity. Predicted to be involved in phosphatidylinositol phosphate biosynthetic process and phosphatidylinositol-mediated signaling. Located in Golgi membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]
PI4KB (Phosphatidylinositol 4-Kinase Beta) is a Protein Coding gene. Diseases associated with PI4KB include Nonparalytic Poliomyelitis and Poliomyelitis. Among its related pathways are Metabolism and PI Metabolism. Gene Ontology (GO) annotations related to this gene include transferase activity, transferring phosphorus-containing groups and 1-phosphatidylinositol 4-kinase activity. An important paralog of this gene is PI4KA.
Phosphorylates phosphatidylinositol (PI) in the first committed step in the production of the second messenger inositol-1,4,5,-trisphosphate (PIP). May regulate Golgi disintegration/reorganization during mitosis, possibly via its phosphorylation. Involved in Golgi-to-plasma membrane trafficking (By similarity). ( PI4KB_HUMAN,Q9UBF8 )
(Microbial infection) Plays an essential role in Aichi virus RNA replication (PubMed:22124328, 27989622, 22258260). Recruited by ACBD3 at the viral replication sites (PubMed:22124328, 27989622). ( PI4KB_HUMAN,Q9UBF8 )
(Microbial infection) Required for cellular spike-mediated entry of human coronavirus SARS-CoV. ( PI4KB_HUMAN,Q9UBF8 )
1q21.3
( Toinen artikkeli seuraavassa otsikossa tästä entsyymistä)
Annedalsklinikan krijastossa nin tämän kirjan ensimmäisen kirjan. ja vuonna 2005 poimin muutamia asioita esiin ja nyt kertailen ja kommentoin 11.3. 2023
Lähde Türk (Larsen) Maria. Cereal- and Microbial Phytases. Phytate Degradation. Mineral binding and Absorption(1999 GU, Chalmers University of technology. Department of Food Science)
Oma alkulause:
Fytiini on pääasiallinen fosfaatin lähde kehoon. Se on myös merkittävä tekijä essentiellien mineraalien lähteenä. Fytiinin rakenteen ytimenä on myo-inositoli ja se on tärkeä lipositoliryhmän fosfolipidien muodostukselle: PI (PtdIns, Fosfatidyyli-inositoli), PIP3, PIP2, IP3) nimisiä molekyylejä sisältävässä aineenvaihdunnan ja signaloinnin modulissa. Tähän moduliin kuuluu ainakin 35 eri jäsentä, sekä rasvaliukoisia että vesiliukoisia. Inositoli itse on vesiliukoinen. Inositolijohdannaiset osallistuvat laajaan solun sisäiseen fosfaattiaineenvaihduntaan ja myös tuman ja genomin asioihin. Tämän takia valitsin suomentaa kappaleita tästä molekyylistä INOSITOLI, joka tulee kasvikunnan fytiinistä. Fytiini-nimensä se sai aluksi sen takia, ettei oikein tiedetty kuuluuko se kasviskuituihin vai ei, vaikka nyt tiedetään, että se on myös osa kiertokulkua animaalisen kudoksen metabolisissa reiteissä, vaikkakaan sitä ei riittävästi syntetisoidukaan kehossa ,sen sijaan sen perusrengasta kierrättyy aikansa. Luonto kyllä tarjoaa runsaasti fytiiniä varsinkin viljassa, jyvissä, pähkinössä ja siemenissä.
Väitöskirja keskittyy kehon ulkopuoliseen tapahtumaan, ravintofytiinin entsymaattiseen pilkkoutumiseen fytaaseilla, mutta poimin väitöskirjsta varsinaisesta fytiinimolekyylistä eräitä olennaisia ja ainutlaatuisia seikkoja tähän suomennokseen. Joku onkin sanonut että fytiini on kehon vahvin antioksidantti. Mene ja tiedä.
Tämä väitöskirja käsittää kuvauksen IP6-molekyylistä ja sen hajoamisesta kohotetusta taikinasta tehtyä leipää valmistettaessa, sen hajomistuotteiden mineraaleja sitovista ominaisuuksista ja viljaperäisten ja mikrobiperäisten fytaasien vaikutuksesta IP6-hydrolyysissä ja ravinnon raudan imeytymisestä ihmisellä.
Fytaasientsyymi
Fytaasi on fytiinille spesifinen entsyymi. Kun tässä puhutaan IP6 -molekyylin entsymaattisesta hajoittamisesta, tarkoitetaan sivuketjujen, eri fosfaattiryhmien purkamisesta.
(
ja samalla fosfaattien
kiinnittämien
mineraalien irtoamisesta
eri PH
miljöössä, fosfaattiryhmien pilkkoutumisestä
irti
syklitolista,
joka itse
ei tässä
hajoa, vaan sitten
taas sopivassa tilanteessa kuten ruoansulatuksen
alavirrassa- kon ihminen on syönyt fytaasilla pilkkoutunutta fytiiniä leivässään- kerää
takaisin kudos- ja soluspesifisesti fosfaattia
ja niihin mineraaleja riippuen
uudesta
fosfaattiryhmäkonformaatiosta. Tutkimustyö kohdistui erilaisten pH-miljöiden merkitykseen tässä asiassa)
( Tässä käännän vain osia itse fytiinistä)
"Fytaasit ovat fosfataaseja.
Fytaasit, jotka pystyvät hydrolysoimaan IP6 molekyyliä, jolloin syntyy alempiasteisesti fosforyloituja inositolifosfaatteja. Tutkittiin sitä vaikutusta inositoliheksafosfaatin hydrolysaatioon, mikä viljan ( vehnän) ja mikrobien ( Aspergillus niger ja Saccharomyces cerevisiae) fytaaseilla vehnässä on.
Kun tehtiin endogeeninen vehnäfytaasin aktivaatio, Bakerin hiivan ( S.cerevisiae) lisäys ja erityisesti A.niger-peräisen fytaasin lisäys, aleni fytiinin (IP6) pitoisuus leivottaessa."
"Fytaasiaktiivisuuden mittaus
Tutkija kehitteli erityisen metodin, jolla voitiin määrätä fytaasin aktiviteetti
mittaamalla IP3 muodostusta. Koska eri fytaasit tuottavat erilaisia IP3-isomeerejä, tätä metodia voidaan myös käyttää erottamaan eri lähteistä tulevia fytaaseja.
Markkinoilla olevat S-cerevisiae- kannat ovat osoittautuneet kykeneviksi kehittämään fytaasiaktiviteettia, esim. kasvamaan synteettisessä mediumissa IP6 ainoana fosforilähteenä. Molemmat tutkitut kannat ilmensivät sellaista aineenvaihduntaa, joka oli hyvin sopeutunut IP6-peräisen fosfaatin hyväksikäyttöön.
Fytaasit osoittautuivat olevan 3-fytaasi tyyppiä eli fytaasit poistavat inositolirenkaan kolmoshiilessä olevan fosfaatin. Tästä seuraa hajoamistuotteet IP5, IP4 ja IP3, tarkemmin: DL-Ins ( 1, 2, 4, 5, 6)P5, DL-Ins (1, 2, 5, 6)P4 ja DL-Ins (1,2,6)P3.
//Huom: IP3 tarkoittaa, että inositoli on sitä sarjaa , jossa on kolme fosfaattiryhmää P. Mutta nämä kolme fosfaattiryhmää voivat sijaita monella eri tavalla myo-inositolirenkaassa. Elävässä solussa ne sijaitsevat usein asemissa 1,4 ja 5 ja IP3 voidaan tarkentaa: Ins (1,4,5) P3 ja se kuuluu tärkeimpiin signaalinvälittäjäaineisiin ihmissoluissa.
Jos P-kirjain on alussa, kuten PI, se tarkoittaa fosfatidyyliryhmää. Inositoli on silloin fosfatidyloitunut. Jos P on I:n jäljessä, se tarkoittaa fosfaattia.Inositoli on fosforyloitunut.
(Fosfatidyyli on fosfatidihapon (PA) happotähde ja sitä on fosfolipideissä vastaamassa rasvahappojen kantamisesta ja fosfolipidin kiinnittymisestä membraanirakenteisiin.muita fosfolipidejä ja membraanilipidejä ovat fosfatidyylikoliini eli lesitiini, fosfatidyyliseriini ja fosfatidyylietanolamini eli kefaliini sekä sfingomyeliini. Mitokondrioissa on kardiolipiini. Inositolien fosfolipidejä sanotaan lipositoleiksi.)
Kun PIP2 pilkkoutuu entsymaattisesti membraaneista esiin ja antaa IP3-molekyyliä ja toista molekyyliä DAG ja (diacylglyseroli) kaikki molekyylit jatkavat kiertokulkuaan ja uudelleen rakentumistaan ne ovat kuin solukonelaitteen osia signaalitehtävissä ja siksi niitä hyödynnetään ja kierrätetään, esim. PI muotoon takaisin ja sitten taas rasvaliukoisiksi membraaniosiksi (PIP, PIP2, PIP3) kun taas vesiliukoiset IPx fosfaatit omaavat funktioverkostonsa sytosolin puolella. Ne voivat myös rikastua jopa kantamaan 7 tai 8 fosfaattiakin. Mutta IP6 muoto on tärkeä siksi että siinä vaiheessa se pääsee solusta ulos ja munuaisiin asti ja tarvittaessa erittyy kehosta pois liikaa fosfaattia sen avulla. Rikastuneet insitolifosfaatit voivat antaa selustatukea jopa ATP/GTP energiajärjestelmille. Sivumennen: Hai käyttää inositolienergiaa. Ihmisen harmaat aivosolut myös. Solutumissakin on näitä korkeaenergisiä inositolifosfaatteja. Oma muistiinpanoni //
”Vehnäfytaasin ja A-niger-fytaasin kyky lisätä raudan imeytymistä fytaattipitoisesta ateriasta tutkittiin radioisotooppitekniikalla koehenkilöiltä. Kun niitä fytaaseja lisättiin ravintoon juuri kun alettiin syödä, endogeenisella vehnäfytaasilla ei näyttänyt olleen tehoa, kun taas A.niger -fytaasin havaittiin huomattavasti lisäävän raudan imeytymistä.
Abstraktin avain sanat ovat: Fytaasi, fytiinin pilkkoutuminen, mineraalien sitoutuminen, raudan absorptio, vilja, dietääriset fytaasit, A.niger, S.cerevisiae.
(Johdanto-osasta
löytyy perusteellista tietoa fytiinistä! Tekniikan paraneminen johti syvällisempään tietoon fosfaattiaineenvaihdunnasta niihin aikoinin! Tässähän on kyse ihmisen bioenergiatason virrankannon välittäjämolekyyleistä ja "maadutustavoista" tietynlaisen elektroneutraaliuden pitämiseksi yllä eikä fosfaatti koskaan esiinny yksinään. Se on puskuriaines, toisaalta se toimii vahvistajana tarpeellisille Ca(2+)-stimuluksille.)
"Nyo-inositoli
Myo-inositoli molekyylillä on kaksi chiraalipuoliskoa. Sillä on C2 -ja C5 -hiilien kautta kulkevan tason suhteen symmetriaa. Jos C2 -tai C5- OH-substituoituu, se ei häiritse yhtäläisyyttä, sen sijaan muitten asemien substituutio johtaa chiraaliseen tuotteeseen, joka on merkittävä joko D- tai L-muodoksi. Chiraaliset agenssit, kuten entsyymit, pystyvät erottamaan näitä eri muotoja, D- tai L- isomeerejä, enantiomeereja. Aiemmin suositeltu numerointi oli sellainen, että pyrittiin matalimpiin subtituenttinumeroihin. Mutta nykyään suositellaan numerointi tehtävän D-muotoon ”counterclock wise”, vastapäivään Agranofin kilpikonnahahmoisessa molekyylissä (Agranofs turtle). Tämä kilpikonna oli kirjan kansikuvana.
Fosfatidyyli-ryhmä (Ptd) asettuu ykköskohtaan; ykköskohdan voi sijoittaa oikealle alakulmaan.
Tällöin Agranofin vuonna 1983 esitetty muistiapu kilpikonna katsoo oikealle, oikea tassu on 1-, pää 2-( aksiaalisen hydroksyylin paikka), vasen tassu 3-, vasen takatassu 4-, häntä 5-, ja oikea takatassu 6-hiilessä)
NC-IUB- nimitys ”ins” tarkoittaa D-konfiguraatiossa olevaa myo-inositolisa, ellei erikseen ole mainittu etuliite L.
(jatkuu)