IP6 ja NHEJ prosessi, DNA:n DSB korjaus

DNA repair NHEJ and IP6 in Double Strand Break (DSB)

IP6 , inostiolihexa-cis-fosfaatin merkitys DNA:n korjautumisessa NHEJ-prosessilla
Google hakusanalla IP6 and DNA repair löytyy 11900 vastausta, joista otan yhden.

LÄHDE:
Les A. Hanakahi and Stephen C. West
Specific interaction of IP6 with human Ku70/80, the DNA-binding subunit of DNA-PK
EMBO J. 2002 April 15; 21(8): 2038–2044.

Abstraktin suomennos:

Eukaryoottisissa soluissa DNA kaksoisrihman vauriot (double strand breaks, DSB) voivat korjautua prosessilla joka riippuu tekijästä Ku/70/80, XRCC4 ja DNA ligaasi IV. ja tämä tie on nimeltään NHEJ, (non-homologous end-joining).

TekijäT XRCC4 ja DNA ligaasi IV kuvattuna:

http://tewlab.path.med.umich.edu/ResearchProjects_files/image003.jpg

Tekijä Ku70/80 kuvattuna:
http://www.gurdon.cam.ac.uk/~jacksonlab/Images/nhej.jpg

Lisäksi imettäväisissä tämä prosessi vaatii DNA-PKcs, joka on DNA:sta riippuvan proteiinikinaasin DNA-PK katalyyttinen alayksikkö (catalytic subunit) .

Aiemmin tutkijat ovat osoittaneet , että IP6 (inositolihexa-cis-fosfaatti) on sitoutuneena DNA-PK entsyymiin ja stimuloi DNA-PK:sta riippuvaa katkenneitten päitten liittymistä koeputkessa, in vitro.

Tässä työssään tutkijat paikallistivat IP6:n sitoutumisen DNA-PK-entsyymin alayksikköihin Ku/70/80. He osoittavat myös, että DNA-PKcs yksinään ei ilmentänyt havaittavaa affiniteettia inositolihexacisfosfaattiin.

Lisäksi Ku/ 70/80 heterodimeerin proteolyysin kartoituksessa IP6 läsnäollessa ja ilman IP6 läsnäoloa havaittiin, että sitoutuminen muuntaa Ku70/80 heterodimeerin konformaatiota.

Tutkijat lokalisoivat IP6:n sitoutumisen Ku/70/80 alayksikköön DNA-PK entsyymissä.

Sitten tutkittiin hiivassa esiintyvää Ku/70/80 homologia yKu70/80. Se ei sitonut inositolihexacisfosfaattia. Joten tästä saatiin viitettä, että inositolihexa-cis-fosfaatin(IP6) funktio NHEJ- korjausprosessissa kuten DNA-PKcs funktiokin ovat ainutlaatuisia nisäkkäitten EJ (end joining) prosessille.

Avainsanat:
DNA repair/
DSB, double-strand breaks
NHEJ, non-homologous end-joining
PK, protein kinase